統計学と疫学と時々、助教生活

疫学を専門とする助教の研究に関する備忘録的ページ。

2016-04-25から1日間の記事一覧

Genetic model (遺伝モデル)とは

今回は特定の遺伝継承のパターンであるGenetic modelについて、記述する。 ここではよく扱われる4つのパターンの性質を定義する。 前提条件 AとBというアレルを持つマーカーMを仮定する。 マーカーMの遺伝子型は、、と表記する。 アレルの頻度は、と表記する…

Rで遺伝子多型とアレルの頻度を算出するコマンド:genotype()

今日はあるSNP(一塩基多型)の遺伝子多型とアレルの頻度を算出するコマンドを紹介する。今回は2016年1月に発売された『実践でわかる!Rによる統計遺伝学』の内容も参考にしている。 初めに 今回使用するデータを丸善のサポートページ(http://pub.maruzen.co…